L'aventure continue pour Sissi, l'impératrice que défie les usages de la cour.

Dans cette nouvelle saison, en France, la proclamation d'une République et la chute soudaine de Napoléon III sèment le trouble jusqu'à Vienne.

En conséquence, François-Joseph impose à son fils Rodolphe de débuter sa formation à l'Académie militaire pour se préparer à son futur rôle de monarque, malgré l'opposition de Sissi. En même temps, face aux protestations des ouvriers sur l'imposant chantier de l'exposition universelle de Vienne, il demande au comte Grünne de s'infiltrer pour découvrir qui a fomenté cette rébellion.